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從代謝組學樣品前處理中看低溫濃縮的重要性

更新時間:2025-11-17    點擊次數:67

· 代謝組學作為系統生物學的重要分支,旨在對生物體(如細胞、組織、器官或整個生物)在特定生理時期內所有小分子代謝物(分子量一般<1500 Da)進行定性與定量研究,揭示其組成、動態變化及內在規律。由于這些小分子(包括糖類、氨基酸、有機酸、核苷酸、脂質等)是新陳代謝的最終產物,代謝組學被認為能夠最直接、準確地反映生物體在特定時間點的生理狀態與表型。

其中樣品的采集與前處理是質譜分析的基石,它們是確保結果可靠性的關鍵環節之一。樣本前處理的準確性直接影響到實驗數據的質量

· 代謝組學樣品前處理流程

從代謝組學樣品前處理中看低溫濃縮的重要性


真空離心濃縮在代謝組學前處理中的解決方案

真空離心濃縮儀作為前處理的濃縮環節起著至關重要的作用,可解決一下問題:

1. 目標物豐度低:對于激素、脂質介質豐度低的樣品在被有機溶劑(如甲醇、乙腈)或水相緩沖液從細胞、組織或體液中提取出來后,通常需要濃縮富集來提高代謝物的濃度,使其達到質譜儀的檢測范圍。

操作步驟

a) 將含有代謝物的有機相或全提取液轉移到耐有機溶劑的離心管中。

b) 將離心管放入真空離心濃縮儀。

c) 儀器通過離心力(防止暴沸和樣品損失)、真空(降低溶劑沸點)和溫和加熱(加速蒸發)的協同作用,將溶劑快速蒸發。

d) 最終在管底得到干燥的代謝物粉末或薄膜。

2. 溶劑置換:在某些實驗設計中,可能需要將代謝物從一種溶劑轉移到另一種溶劑中。例如:從正己烷(用于脂質提?。┲脫Q到氯仿/甲醇中,或者從含有揮發性緩沖鹽的溶液中置換到純水中。

操作步驟:先通過真空離心濃縮將原始溶劑幾乎蒸干,然后加入目標溶劑,渦旋振蕩使代謝物充分復溶

低溫濃縮在代謝組學中的重要意義

· 1. 防止樣品降解、氧化、或者揮發導致的樣品損失:許多關鍵的代謝物對熱非常敏感,即使在中等溫度(如30-45°C)下也可能穩定。這些代謝物包括多不飽和脂肪酸(PUFAs)、某些維生素(如維生素C)、兒茶酚胺、褪黑素等。再或者短鏈脂肪酸、醛類、酮類、酯類等揮發性物質。

· 2. 抑制代謝反應:同時雖然提取時通常會滅活酶,但某些酶可能仍有殘留活性。 低溫可以抑制任何潛在的酶促反應,防止代謝物輪廓在樣本處理過程中繼續變化。

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吉艾姆Auto R1-plus冷凍真空離心濃縮儀提供樣品保護,濃縮效率高、且不發生交叉污染,全程確保樣品處于較低溫度??蓾M足不同樣品的處理需求。Auto R1-plus可兩段控溫及真空調節,可減少對于揮發性代謝物的損失。


結論:

在代謝組學研究中,選擇冷凍離心濃縮儀是較為理想的選擇。代謝組學聚焦生物體內小分子代謝物分析,這些代謝物對溫度敏感。而冷凍離心濃縮儀的低溫環境可防止代謝物因高溫發生降解、變性或揮發,確保樣品完整性。它能快速濃縮樣品,提高代謝物濃度,為后續檢測分析提供高質量樣本,且高效的濃縮能力可提升實驗效率,能更好地滿足代謝組學研究對樣品處理的嚴格要求。



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